لعبت جامعة النجاح الوطنية دوراً بارزاً ومهماً في الدفاع عن مدينة القدس، من خلال تسليط الضوء على قضايا المدينة وهمومها سياسياً واجتماعياً واقتصادياً و أدبياً، وقد دأبت جامعة النجاح على عقد مؤتمر يوم القدس منذ عام 1995 وتواصل عقد هذا المؤتمر، حتى وصل الى اثنى عشر مؤتمراً، ومع كل مؤتمر كان الأكاديميون يتناولون موضوعات على قدر كبير من الأهمية، بهدف تبصير المعنيين بالواقع الصعب الذي تعيشه المدينة المقدسة.